Такие яблони болеют абсолютно такими же заболеваниями, что и простые. Чаще всего колоновидная яблонька заболевает такими болезнями, как: пролиферация, или ведьмина метла, горькая плодовая гниль, мозаика, мозаичная кольчатость, мухосед, мучнистая роса, млечный блеск, трутовик, обыкновенный рак, парша, отмирание ветвей, плодовая гниль, подкожная вирусная пятнистость, резиновидность, ржавчина, стекловидность плодов, сплющенность веток, черный рак и цитоспороз.
